香格里拉市地处高海拔低纬度地带，气候随海拔升高而变化，依次出现六个气候带，属典型的立体农业气候。香格里拉地势南低北高，南部迎南来暖湿气流，降水相对于丰富，气候湿润，北部则相对干燥。香格里拉地形结构复杂，各种气候类型相嵌交错，同一气候垂直带内又有森林气候、草原气候、湖盆气候等单个小地形气候，形成隔里不同天的气候特征。